Có bằng chứng cho thấy nó gây ra enzyme cytochrom P-450 đặc biệt là CYP2C9. Một số loại thuốc có cửa sổ trị liệu hẹp, như warfarin và nifedipine, được chuyển hóa bởi CYP2C9.[6]

Nafcillin chứa muối được thêm vào như là phương tiện ổn định. Những muối được thêm vào có thể gây phù hoặc tích tụ chất lỏng. Sẽ là khôn ngoan để tránh thuốc này nếu có mối lo ngại về suy tim sung huyết hoặc bệnh thận.